Su tradición académica es legada desde 1964 por la Universidad de Chile y la Universidad Técnica del Estado cuyas sedes de Osorno y Puerto Montt se fusionaron en 1981 dando origen al Instituto Profesional de Osorno. En 1993, mediante la presentación de un proyecto y una exitosa gestión, se crea la actual Universidad de Los Lagos.
Para atender su matrícula superior a los 4.440 alumnos, la Universidad de Los Lagos tiene dependencias tanto en Osorno como en Puerto Montt con diversos y especializados laboratorios científicos, de computación y de idiomas, una Planta Piloto en el área de alimentos, un Barco Escuela en Puerto Montt, una Clínica Psicopedagógica y Jardín Infantil para la formación de especialistas, unidad de radio y televisión, talleres fotográficos, de arte y teatro, salas de música, de cine y de conferencias, salas de estudio y casinos, canchas, multicanchas.
En Osorno posee un Campus de 22 hectáreas, con 24.616 metros cuadrados construidos, además del legado arquitectónico de una casa de 1.776 metros cuadrados de clásico estilo alemán destinada a la Escuela de Arquitectura. También tiene una Casa Central, ubicada en el centro de la ciudad, y un Instituto Tecnológico como alternativa a la formación de pregrado.
En Puerto Montt, la Universidad de Los Lagos tiene instalaciones destinadas a labores académicas con una superficie construida de más de 9.300 metros cuadrados. Posee, además, una Piscicultura Experimental de Acuicultura y Ciencias del Mar en la localidad de Metri, en el Km. 30 de la Carretera Austral, y otras Estaciones de Piscicultura y Cultivo de Salmones en Quinchao y Río Sur. Se suman a estas instalaciones, una Estación de Limnología en el Lago Rupanco y un Fundo Forestal de 300 hectáreas en la Barra del Río Bueno. La Universidad también desarrolla acciones docentes y de extensión en Coyhaique y en Santiago, se encuentra el Campus República destinado a actividades académicas y a diversas acciones institucionales.
